Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC25A48Q6ZT89 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC25A48Q6ZT89 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms