Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3FQ6ZSY5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3FQ6ZSY5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms