Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC129Q6ZRS4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms