Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMFQ6X4W1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms