Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD300LDQ6UXZ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms