Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALKAL1Q6UXT8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms