Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK4Q6SA08 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms