Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATAD2Q6PL18 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATAD2Q6PL18 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms