Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO38Q6PIJ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO38Q6PIJ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms