Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC4Q6P2E9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC4Q6P2E9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms