Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRNP1Q6NT89 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNP1Q6NT89 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms