Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms