Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPH2Q6IBW4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms