Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms