Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A4Q6AI14 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms