Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms