Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF20Q5VTR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF20Q5VTR2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms