Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP350Q5VT06 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP350Q5VT06 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms