Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GKAP1Q5VSY0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GKAP1Q5VSY0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms