Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms