Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCP2LQ5T4T6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms