Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms