Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCID2Q5JVF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms