Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CT47A1Q5JQC4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CT47A1Q5JQC4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms