Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SBK1Q52WX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBK1Q52WX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms