Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms