Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDRF1Q3B7T1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms