Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM1Q2NKQ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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