Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC27Q2M243 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms