Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms