Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PTPRNQ16849 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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PTPRNQ16849 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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