Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHQ16836 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHQ16836 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHQ16836 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHQ16836 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHQ16836 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHQ16836 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HADHQ16836 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms