Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms