Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA3Q16787 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA3Q16787 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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