Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FSCN1Q16658 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FSCN1Q16658 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms