Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRY1Q16526 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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