Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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