Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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