Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUM3Q15397 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PUM3Q15397 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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