Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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