Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCD1Q15116 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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