Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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