Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF1Q14990 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF1Q14990 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF1Q14990 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ODF1Q14990 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF1Q14990 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF1Q14990 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF1Q14990 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF1Q14990 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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ODF1Q14990 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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ODF1Q14990 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF1Q14990 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ODF1Q14990 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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