Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC1AQ14683 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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