Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms