Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BECN1Q14457 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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