Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA3CQ13748 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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