Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4BQ13620 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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