Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM5Q13571 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM5Q13571 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms