Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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MTM1Q13496 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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MTM1Q13496 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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MTM1Q13496 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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MTM1Q13496 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTM1Q13496 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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MTM1Q13496 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MTM1Q13496 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MTM1Q13496 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MTM1Q13496 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MTM1Q13496 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTM1Q13496 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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